潔凈室常按照用途分類。分類情況如下：1、工業潔凈室---以無生命微粒（包括無機微粒和有機性微粒）的控制對象。主要控制無生命微粒對工作對象的污染，其內部般保持正壓。適用于精密工業潔凈室、電子工業潔凈室、航天工業潔凈室、化學工業潔凈室、原子能工業潔凈室、印刷工業潔凈室和照相工業潔凈室等部門。2、生物潔凈室-------以有生命微粒的控制對象又可分為：1）、一般生物潔凈室。主要控制有生命微粒（例如單細胞藻類、菌類、原生動物、細胞和病毒等）對工作對象污染。同時其內部材料要能經受各種滅菌侵蝕，內部一般保持正壓，可分為：食品工業潔凈室、制藥工業潔凈室、醫療設備潔凈室、動物實驗室，2）、生物安全潔凈室、要求控制的室內參數基本上與一般生物潔凈室相同，主要控制有生命的微粒對環境和人體的污染，不同的是室內的靜壓差要比室外環境低一定數值。

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